遺傳多(duō)樣性小鼠模型

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遺傳多(duō)樣性小鼠模型

遺傳多(duō)樣性小鼠模型

中文名稱:

 遺傳多(duō)樣性小鼠模型 

英文名稱:

 Genetic Diversity Mice 

類型:

 遺傳多(duō)樣性動物(wù)模型 

分(fēn)級:

 NA 

研制單位:

 中國醫學科學院醫學實驗動物(wù)研究所 

保存單位:

 中國醫學科學院醫學實驗動物(wù)研究所 

主要用(yòng)途:

用(yòng)于多(duō)基因連鎖分(fēn)析和(hé)新的(de)疾病模型鑒定。 

是否通(tōng)過鑒定與評價:

 

一、研究背景

遺傳多(duō)樣性小鼠(Genetic Diversity Mice, GD mice)是由遺傳背景清晰、遺傳信息豐富的(de)8個(gè)親本近交系相互雜(zá)交,再進行全同胞兄妹交配20代以上,獲得(de)的(de)大(dà)型重組近交小鼠群體。每個(gè)GD小鼠品系同時(shí)擁有8個(gè)親本品系的(de)遺傳信息,是能夠體現人(rén)群遺傳多(duō)樣性和(hé)個(gè)體差異性的(de)新模型。

1) 遺傳背景清晰:用(yòng)于建立GD小鼠的(de)8個(gè)原始親本和(hé)已經建成的(de)GD小鼠各品系均已完成全基因組重測序,擁有豐富、完整的(de)遺傳信息數據提供支持與應用(yòng)。

2) 遺傳多(duō)樣性:親本品系包括5種實驗室常用(yòng)近交系和(hé)3種野生近交系。8個(gè)親本具有相對(duì)較遠(yuǎn)的(de)的(de)親緣關系,覆蓋了(le)全部小鼠基因組90%的(de)遺傳變異,保證了(le)子代GD小鼠遺傳位點的(de)多(duō)樣性和(hé)分(fēn)散性。

3) 表型的(de)多(duō)樣性GD小鼠同時(shí)擁有基因多(duō)态性和(hé)分(fēn)離多(duō)态性,遺傳信息的(de)多(duō)樣性進而驅動了(le)GD小鼠表型的(de)多(duō)樣性。不同品系遺傳多(duō)樣性小鼠在生長(cháng)、發育、壽命、疾病的(de)發生和(hé)發展方面表現出顯著品系間的(de)差異性,可(kě)以很好的(de)模拟人(rén)群的(de)遺傳多(duō)樣性和(hé)個(gè)體差異性。

二、制備方法

8個(gè)親本品系通(tōng)過連續3代協同重組雜(zá)交,獲得(de)具有40,000種可(kě)能的(de)第三代雜(zá)交小鼠,第三代雜(zá)交小鼠再進行20代以上的(de)全同胞兄妹交配,最終繁育形成彼此獨立的(de)、不同的(de)GD小鼠品系。每個(gè)品系随機獲得(de)8個(gè)親本小鼠的(de)遺傳變異。在GD小鼠模型建立過程中,任何一個(gè)遺傳位點上的(de)各親本品系的(de)等位基因頻(pín)率理(lǐ)值爲 0.1251/8)。這(zhè)是基于常染色體位點上的(de)運算(suàn),而非線粒體基因組和(hé)性染色體。因此,在重組近交系的(de)建立過程中,還(hái)應注重性染色體(X/Y)和(hé)常染色體上重組的(de)平衡。

三、評價與驗證

1) 遺傳信息的(de)多(duō)樣性:用(yòng)于GD小鼠建立的(de)8個(gè)親本包括實驗室常用(yòng)的(de)近交系小鼠A/JC57BL/6J 和(hé) 129S1/SvImJ2種可(kě)用(yòng)于糖尿病與肥胖症研究的(de)品系包括來(lái)自日本的(de)NOD/LtJ和(hé)來(lái)自新西蘭的(de)NZO/iLtJ3種來(lái)自小家鼠種(Mus musculus)不同亞種的(de)野生近交系,分(fēn)别爲自捷克的(de)PWK/PhJ (Mus musculus musculus)、美(měi)國的(de) WSB/EiJ (Mus musculus domesticus)、以及泰國的(de)CAST/EiJ (Mus musculus castaneus)。這(zhè)8個(gè)親本小鼠的(de)遺傳信息可(kě)以覆蓋小鼠全基因組的(de)90%,品系間總共存在36M的(de)單核苷酸多(duō)态性(SNPs),确保子代重組近交系群體遺傳多(duō)樣性的(de)最大(dà)化(huà)。全基因組測序結果顯示,通(tōng)過重組建立的(de)GD小鼠,每個(gè)品系平均擁有7,438,457個(gè)SNPs1,759,945個(gè)Indels

四、討(tǎo)論和(hé)結論

GD小鼠是由8個(gè)近交系小鼠,通(tōng)過3代協同重組雜(zá)交,再經20代近交傳代,獲得(de)的(de)重組近交系。相比8個(gè)原始親本,GD小鼠擁有豐富的(de)遺傳型和(hé)表型,可(kě)用(yòng)于多(duō)基因連鎖分(fēn)析和(hé)新的(de)疾病模型鑒定。